在使用压力蒸汽灭菌器的过程中，需要注意以下几个问题：

1. 清洁卫生：灭菌器必须保持干净和卫生，减少微生物的污染和残留，避免灭菌不彻底或交叉感染。在使用前和使用后要进行清洗和消毒。

2. 合理装载：在灭菌器中装载物品时要合理分配，避免过于密集或过于稀疏，确保蒸汽能够充分渗透到物品内部，达到灭菌的效果。

3. 控制时间和温度：要严格控制灭菌的时间和温度，确保达到灭菌的要求。灭菌时间和温度一般根据物品的不同而有所不同，使用前要认真阅读说明书，了解要求。

4. 水位控制：在灭菌器使用过程中，要注意控制水位，确保水位充足，避免在灭菌过程中由于水位不足而影响灭菌效果。

5. 安全操作：在使用过程中，要注意安全操作，避免烫伤和其他意外伤害。操作前要熟悉设备的使用说明和安全操作规程，确保正确操作。在灭菌器内有高压蒸汽时，绝对不能打开灭菌器门。

6. 维护保养：使用完毕后，要及时进行清洁和维护保养，确保设备的长期使用和灭菌效果的稳定。需要注意更换损坏的部件和消耗品，保持设备的完好状态。

总之，在使用压力蒸汽灭菌器的过程中，需要注意上述几个问题，以确保灭菌效果和设备的正常使用。